电火花高速穿孔机除了平时每次使用完毕后，要把工作台面上的水和工件残渣清理干净．以免长时间的积水腐蚀机械造成积水盘生锈，产生漏水。还要经常对电火花穿孔机的水泵保养，因为水泵在电火花穿孔机中是一个非常重要的部件，如果电火花穿孔机使用的是气动泵，一般情况下运行的工作压力为10Mpa，因此过滤和压缩空气排水要格外注意。如果压缩空气不纯的话，则容易造成拉缸。如果电火花穿孔机使用的是水泵，那么运行的工作压力一般在7Mpa，工作时里面的曲轴承受着非常大的压力，如果润滑油经过一段时间工作后不及时更换的话，就会造成容易磨损的后果。而且需要时常清理以及更换自来水上的过滤器，否则水中的杂质会对铜管造成堵塞，导致使用过程中产生不稳定现象或是烧坏铜管。所以用户不能忽略。

其次是电火花穿孔机旋转头的维护保养，和电火花穿孔机水泵差不多，旋转头也是在高压下工作的，其密封件需要定期更换，如果到了出现漏水的情况再更换的话，有可能水已经渗透到了轴承，导致轴承生锈及卡死现象，将影响机器的使用寿命，那样造成损失就更大了。

丝杆也是电火花穿孔机床的重要部件之一，丝杆分为X轴Y轴Z轴，机床在运作过程中会对丝杆造成磨损，因此，为了减少丝杆的损耗，需要每天在运作前对机器进行检查，将机油注入。其中有个值得注意的地方是，丝杆的Z轴是在里面的，是无法直接看到的。因此在加油的时候以及涂黄油的时候一定要将油嘴对准丝杆，以确保机油能准确注入。